
تعداد نشریات | 26 |
تعداد شمارهها | 447 |
تعداد مقالات | 4,557 |
تعداد مشاهده مقاله | 5,380,005 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 3,580,079 |
تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی و فیلوژنتیکی ژن های NADH3 وNADH4L ژنوم میتوکندری شتر دو کوهانه ایران | ||
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی | ||
مقاله 11، دوره 7، شماره 3، آذر 1394، صفحه 163-174 اصل مقاله (596.68 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22103/jab.2015.1139 | ||
نویسندگان | ||
امین شهابی؛ مجتبی طهمورث پور | ||
چکیده | ||
حفظ تنوع ژنتیکی در نژادهای بومی ایران به عنوان سرمایه ملی بسیار حائز اهمیت است. بررسی توالی ژنوم میتوکندری در بین نژادها یا در درون آنها می تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت های مورد مطالعه باشد. هدف از پژوهش اخیر، بررسی بیوانفورماتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ژنهای NADH3 وNADH4L از ژنوم میتوکندری در شترهای دوکوهانه ایرانی بود. بدین منظور10 نمونه خون از شترهای دوکوهانه ایران جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA، تکثیر قطعه 971 جفت بازی از ژنوم میتوکندری شتر دوکوهانه توسط آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی به صورت رفت و برگشت توالی یابی شدند. نتایج به دست آمده تعداد 2 هاپلوتیپ مختلف بر اساس یک جایگاه چند شکل موجود در توالی ها نشان دادند و همچنین توالی نهایی بدست آمده از هاپلوتیپ ها با طول تقریبی715 جفت باز که شامل 73/27 درصد آدنین، 70/13 درصد گوانین، 63/25 درصد سیتوزین،77/32 درصد تیمین بود. مقایسه توالی های نوکلئوتیدی و اسیدآمینه ای ژن های NADH3 وNAD4L در شتر دو کوهانه ایرانی نشان داد که این گونه با شتر دو کوهانه اهلی دارای فاصله ژنتیکی نزدیکی است. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از روش Neighbor-Joining نشان داد، که این گونه در میان خانواده شترسانان، با Lama کمترین قرابت را دارند. | ||
کلیدواژهها | ||
ژن NADH3؛ ژن NADH4L؛ شتر دوکوهانه ایران؛ ژنوم میتوکندری | ||
مراجع | ||
Ahmed MM, El-Shazly SA, Sayed SM and Amer SA. (2013). Molecular study of energy related mitochondrial genes in Arabian and bactrian camels.American Journal of Biochemistry and Biotechnology 9:61-70.Al-Swailem AM, Shehata MM, Abu-Duhier FM, Al-Yamani EJ and Al-Busadah KA et al. (2010). Sequencing, Analysis and Annotation of ExpressedSequence Tags for Camelus dromedaries. PLoS One 5:e10720.
Alinaghizadeh H, Mohammad Abadi MR, Zakizadeh S (2010). Exon 2 of BMP15 gene polymorphism in Jabal Barez Red Goat. Agricultural Biotechnology 2: 69-80.
Ansari-Renani H, Salehi M, Ebadi Z and Moradi S. (2010). Identification of hair follicle characteristics and activity of one and two humped camels. Small Ruminant Research 90(1):64-70.
Beaumont AR and Hoare K. (2003). Biotechnology and genetics in fisheries and aquaculture. Blackwell Science Ltd.
Cui P, Ji R, Ding F, Qi D, Gao H, Meng H, Yu J, Hu S and Zhang H. ( 2007). A complete mitochondrial genome sequence of the wild two-humped camel (Camelus bactrianus ferus): an evolutionary history of camelidae. BMC Genomics 8:241.
Eyre-walker A, Awadalla P. (2001). Does human mtDNA recombine Journal of Molecular Evolution 53: 430-435.
Ghasemi Meymandi M, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK (2015). Genetic variation of camels in the North of Kerman province using microsatellite markers. Animal Production Research 4: 35-45.
Ji R, Cui P, Ding F, Geng J, Gao H, Zhang H, Hu S and Meng H.(2009). Monophyletic origin of domestic bactrian camel (Camelus bactrianus) and its evolutionary relationship with the extant wild camel (Camelus bactrianus ferus). Animal Genetics 40: 377–382.
Mohammadi A, Nassiry MR, Mosafer J, Mohammadabadi MR, Sulimova GE (2009). Distribution of BoLA-DRB3 allelic frequencies and identification of a new allele in the Iranian cattle breed Sistani (Bos indicus). Russian Journal of Genetics 45: 198-202.
Mousavizadeh A, Mohammad Abadi MR, Torabi A, Nassiry MR, Ghiasi H, AliEsmailizadeh AK (2009). Genetic polymorphism at the growth hormone locus in Iranian Talli goats by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP). Iranian Journal of Biotechnology 7: 51-53.
Nei M and Kumar S. (2000). Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press, New York.
Pirani N, Mohammadhashemi A, Alijani S, Rezazadeh Goli R, Ghanbari S .( 2010). Molecular Analysis of Mazandrani native chicken population based on HVR-I region of Mitochondrial DNA. Journal of Agriculture Biotechnology 1(2): 53- 60.
Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. (2011). MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution 28: 2731-2739. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,487 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,039 |