
تعداد نشریات | 26 |
تعداد شمارهها | 447 |
تعداد مقالات | 4,557 |
تعداد مشاهده مقاله | 5,379,999 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 3,580,063 |
ارزیابی بیان افتراقی ژن هموسپرمیدین سینتاز ۱ (HSS1) در بافتهای مختلف گیاه دارویی زلف پیر (Senecio vulgaris L.) | ||
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی | ||
مقاله 8، دوره 10، شماره 4 - شماره پیاپی 32، اسفند 1397، صفحه 134-146 اصل مقاله (993.3 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22103/jab.2019.2253 | ||
نویسندگان | ||
هاشم مراونه1؛ اسدالله احمدیخواه* 2؛ مسعود توحیدفر3 | ||
1دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی، گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران | ||
2استادیار، گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران. ایران. | ||
3دانشیار، گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران. ایران. | ||
چکیده | ||
هدف: اولین آنزیم مسیر اختصاصی بیوسنتز آلکالوئیدهای پیرولیزیدینی (PA)، هموسپرمیدین سینتاز (HSS) است. HSS انتقال NAD1 وابسته به یک گروه آمینوبوتیل اسپرمیدین را به پوترسین کاتالیز میکند. پوترسین، اسپرمیدین و اسپرمین سه پلیآمینی هستند که بطور طبیعی دارای بار مثبت بوده و تقریبا در تمام سلولهای زنده یافت میشوند. این ترکیبات به DNA متصل شده و در تعدادی از فرآیندهای حیاتی مانند تقسیم سلولی، تمایز و عملکرد غشاء دخالت دارند. گزارشهای بسیار اندکی در مورد بیان ژن هموسپرمیدین سینتاز ۱ (HSS1) در گیاه دارویی زلف پیر (Senecio vulgaris) به خصوص در شرایط طبیعی گزارش شده است. هدف از پژوهش حاضر بررسی بیان ژن هموسپرمیدین سینتاز ۱ در بافتهای مختلف گیاه دارویی زلف پیر (S. vulgaris)با استفاده از PCR در زمان واقعی بود. مواد و روشها: RNA کل از ریشهها، شاخسارهها (ساقهها و برگها) و گلها استخراج شد و به cDNA تبدیل شد. آغازگرهای اختصاصی برای ژن HSS1 و نیز برای Pol II(به عنوان ژن خانهدار مرجع در آزمایش)، طراحی شد و بیان نسبی ژن با استفاده از روش پی سی آر در زمان واقعی بررسی شد. نتایج: منحنی ذوب دو ژن نشان دهنده تکثیر اختصاصی در PCR بود. ارزیابی سطح بیان نرمال شده ژن HSS1 نشان داد که این ژن به صورت متفاوتی در اندامهای مختلف S. vulgaris بیان شده است. حداکثر بیان نسبی (تغییرات بیش از 59 برابر نسبت به ژن مرجع Pol II) در ریشههایی که هموسپرمیدین سینتاز فعال است و هموسپرمیدین تولید میشود مشاهده شد. علاوه بر آن این ژن در گلها نیز به میزان کمتری (افزایش ۴ برابر نسبت به ژن خانهدار Pol II). بیان شد. طبق انتظار، این ژن بیان نسبی قابل توجهی در شاخسارهها یعنی جایی که هموسپرمیدین حمل میشود، نشان نداد. نتیجهگیری: بیان ژن HSS1 در گیاه زلف پیر به صورت ویژه بافتی است و در ریشهها بیشتر از دیگر بافتها میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
بیان ژن؛ پی سی آر در زمان واقعی؛ زلف پیر؛ شرایط طبیعی؛ هموسپرمیدین سینتاز | ||
مراجع | ||
References Aerts JL, Gonzales MI, Topalian SL (2004) Selection of appropriate control genes to assess expression of tumor antigens using real-time RT-PCR. Biotechniques 36, 84-97. Akdogan G, Tufekci ED, Uranbey S, Unver, T (2016) miRNA-based drought regulation in wheat. Functional and Integrative Genomics 16, 221-233. Al-Bader MD, Al-Sarraf HA (2005) Housekeeping gene expression during fetal brain development in the rat-validation by semi-quantitative RT-PCR. Devel Brain Res 156, 38-45. Baker, HG (1974). The evolution of weeds. Ann Rev Ecol Systematics 5(1), 1-24. Böttcher F, Adolph RD, Hartmann T (1993) Homospermidine synthase, the first pathway-specific enzyme in pyrrolizidine alkaloid biosynthesis. Phytochem 32, 679-689. Chuaqui RF, Bonner RF, Best CJ et al. (2002) Post-analysis follow-up and validation of microarray experiments. Nat Genet 32, 509-514. del Mar Romero M, del Mar Grasa M, Esteve M et al. (2007) Semiquantitative RT-PCR measurement of gene expression in rat tissues including a correction for varying cell size and number. Nutr Metabol 4, 26. Dolan LC, Matulka RA, Burdock GA (2010) Naturally occurring food toxins. Toxins 2, 2289-2332. Dündar E, Suakar Ö, Unver T, Dagdelen A (2013) Isolation and expression analysis of cDNAs that are associated with alternate bearing in Olea europaea L. cv. Ayvalık. BMC Genomics 14, 219. Eren H, Pekmezci MY, Okay S et al. (2015) Hexaploid wheat (Triticum aestivum) root miRNome analysis in response to salt stress. Ann Appl Biol 167, 208-216. Fu PP, Chou MW, Xia Q et al. (2001) Genotoxic pyrrolizidine alkaloids and pyrrolizidine alkaloid N-oxides—mechanisms leading to DNA adduct formation and tumorigenicity. J Environ Sci Health, Part C 19, 353-385. Ginzinger DG (2002) Gene quantification using real-time quantitative PCR: an emerging technology hits the mainstream. Exp Hematol 30, 503-512. Gurkok T, Turktas M, Parmaksiz I, Unver T (2015) Transcriptome profiling of alkaloid biosynthesis in elicitor induced opium poppy. Plant Mol Biol Rep 33, 673-688. Hartmann T (1999) Chemical ecology of pyrrolizidine alkaloids. Planta 207, 483-495. Hartmann T, Ehmke A, Eilert U et al. (1989) Sites of synthesis, translocation and accumulation of pyrrolizidine alkaloid N-oxides in Senecio vulgaris L. Planta 177, 98-107. Hartmann T, Sander H, Adolph R, Toppel G (1988) Metabolic links between the biosynthesis of pyrrolizidine alkaloids and polyamines in root cultures of Senecio vulgaris. Planta 175, 82-90. Hartmann T, Toppel G (1987) Senecionine N-oxide, the primary product of pyrrolizidine alkaloid biosynthesis in root cultures of Senecio vulgaris. Phytochem 26, 1639-1643. Inal B, Türktaş M, Eren H et al. (2014) Genome-wide fungal stress responsive miRNA expression in wheat. Planta 240, 1287-1298. Kaiser A (1999) Cloning and expression of a cDNA encoding homospermidine synthase from Senecio vulgaris (Asteraceae) in Escherichia coli. Plant J 19, 195-201. Kempen HM, Graf J (1981) Weed seed production. Proc West Soc Weed Sci 34, 78-81. Kumar R, Joyner RW (2003) Expression of protein phosphatases during postnatal development of rabbit heart. Mol Cell Biochem 245, 91-98. Lutman PJW, Berry KJ, Freeman SE (2008) Seed production and subsequent seed germination of Senecio vulgaris (groundsel) grown alone or in autumn‐sown crops. Weed Res 48, 237-247. Maroufi A, Van Bockstaele E, De Loose M (2010) Validation of reference genes for gene expression analysis in chicory (Cichorium intybus) using quantitative real-time PCR. BMC Mol Biol 11, 15. Mattocks AR (1986) Chemistry and toxicology of pyrrolizidine alkaloids, Academic Press, London, UK, pp. 134-152. Mitich LW (1995) Common groundsel (Senecio vulgaris). Weed Technol 9, 209-211. Moritz DML, Kadereit JW (2001) The genetics of evolutionary change in Senecio vulgaris L.: a QTL mapping approach. Plant Biol 3, 544-552. Nolan T, Hands RE, Bustin SA (2006) Quantification of mRNA using real-time RT-PCR. Nature Protocols 1, 1559-1582. Ober D, Hartmann T (1999) Homospermidine synthase, the first pathway-specific enzyme of pyrrolizidine alkaloid biosynthesis, evolved from deoxyhypusine synthase. Proc Natl Acad Sci 96, 14777-14782. Ollerton, J, & Lack, AJ (1992). Flowering phenology: an example of relaxation of natural selection? Trend Ecol Evol 7, 274-276. Rasmussen S, Barah P, Suarez-Rodriguez MC et al. (2013) Transcriptome responses to combinations of stresses in Arabidopsis. Plant Physiol 161, 1783-1794. Roberts HA (1982) Seasonal patterns of weed emergence. Proc. of Aspects of Applied Biology: broad-leaved weeds and their control in cereals. March 24-25, 1982. University of Warwick, England. pp. 321-322. Robinson DE, O’Donovan JT, Sharma MP et al. (2003) The biology of Canadian weeds. 123. Senecio vulgaris L. Can J Plant Sci 83, 629-644. Roeder E (1995) Medicinal plants in Europe containing pyrrolizidine alkaloids. Pharmazie 50: 83-98. Roeder E, Wiedenfeld H (2013) Plants containing pyrrolizidine alkaloids used in the Traditional Indian Medicine–including Ayurveda. Die Pharmazie- Inter J Pharm Sci 68, 83-92. Schulz M, Meins J, Diemert S et al. (2015) Detection of pyrrolizidine alkaloids in German licensed herbal medicinal teas. Phytomedicine 22, 648-656. Shun T, Koluch J, Šantavý F (1960) Isolierung der alkaloide aus dem gemeinen kreuzkraut (Senecio vulgaris L.). Coll Czechoslovak Chem Com 25, 934-939. Smith LW, Culvenor CCJ (1981) Plant sources of hepatotoxic pyrrolizidine alkaloids. J Nat Prod 44, 129-152. Stegelmeier BL, Edgar JA, Colegate SM et al. (1999) Pyrrolizidine alkaloid plants, metabolism and toxicity. J Nat Toxins 8, 95-116. Strati A, Markou A, Parisi C et al. (2011) Gene expression profile of circulating tumor cells in breast cancer by RT-qPCR. BMC Cancer 11, 422. Tholl D, Ober D, Martin W et al. (1996) Purification, molecular cloning and expression in Escherichia coli of homospermidine synthase from Rhodopseudomonas viridis. FEBS J 240, 373-379. Tombuloglu H, Ozcan I, Tombuloglu G et al. (2016) Aquaporins in boron-tolerant barley: identification, characterization, and expression analysis. Plant Mol Biol Rep 34, 374-386. Toppel G, Witte L, Riebesehl B et al. (1987) Alkaloid patterns and biosynthetic capacity of root cultures from some pyrrolizidine alkaloid producing Senecio species. Plant Cell Rep 6, 466-469. VanGuilder HD, Vrana KE, Freeman WM (2008) Twenty-five years of quantitative PCR for gene expression analysis. Biotechniques 44, 619. Weiner J, Rosenmeier L, Massoni ES et al. (2009) Is reproductive allocation in Senecio vulgaris plastic? Botany 87, 475-481. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 589 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 419 |