
تعداد نشریات | 26 |
تعداد شمارهها | 447 |
تعداد مقالات | 4,557 |
تعداد مشاهده مقاله | 5,379,999 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 3,580,063 |
بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپهای زیرهسبز (Cuminum cyminum) خراسان با استفاده از نشانگرهای رپید و آیاساسآر | ||
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی | ||
مقاله 4، دوره 11، شماره 1 - شماره پیاپی 33، خرداد 1398، صفحه 75-98 اصل مقاله (4.7 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22103/jab.2019.12102.1050 | ||
نویسندگان | ||
محمد ضابط1؛ آتنا رحیمی2؛ علی ایزانلو2؛ زهره علیزاده2 | ||
1گروه زراعت- دانشکده کشاورزی- دانشگاه بیرجند | ||
2زراعت | ||
چکیده | ||
هدف: تعیین میزان تنوع ژنتیکی در مواد گیاهی، گام اولیه برای شناسایی، حفظ و نگهداری ذخایر توارثی و همچنین پایه و اساس تحقیقات ژنتیکی و برنامههای اصلاحی است. هدف از این پژوهش بررسی تنوع ژنتیکی و دستهبندی اکوتیپهای زیرهسبز جمعآوری شده از استانهای خراسان شمالی، رضوی و جنوبی بر اساس نشانگرهای RAPD و ISSR بود. موادوروشها: در این تحقیق 20 اکوتیپ مختلف زیرهسبز به منظور استخراج DNA در دانشکده کشاورزی بیرجند کشت گردید. کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از دو روش نانودراپ و الکتروفورز ژل آگارز یک درصد مورد بررسی قرار گرفت. برای بررسی تنوع ژنتیکی از نه آغازگر RAPD و 30 آغازگر ISSR استفاده شد. نتایج: نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که بین و درون جمعیتها تنوع وجود دارد. بر اساس نشانگر RAPD، 10 درصد از تغییرات مربوط به بین جمعیتها و 90 درصد مربوط به درون جمعیتها و بر اساس نشانگر ISSR، نه درصد از تغییرات مربوط به بین جمعیتها و 91 درصد مربوط به درون جمعیتها بود. درصد چندشکلی بدست آمده از نشانگر RAPD و ISSR به ترتیب 62 و 70 درصد؛ میانگین محتوای چندشکلی 26/0 و 3/0؛ میانگین شاخص اطلاعاتی شانون 37/1 و 9/1 و میانگین شاخص اطلاعاتی نی 1/2 و 76/2 بدست آمد. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که در نشانگر RAPD دو مولفه اول 6/40 درصد و در نشانگر ISSR چهار مولفه اول 6/49 درصد از تغییرات را توجیه کردند. تجزیه خوشهای بر اساس ماتریس تشابه اکوتیپهای مورد مطالعه را به ترتیب در 6 و 7 خوشه گروهبندی نمود. نتیجه گیری: با توجه به اطلاعات حاصله از جمله، درصد چند شکلی، دامنه زیاد بین ضرایب تشابه (جاکارد) حاصل شده و گروهبندی اکوتیپها در خوشه های مجزا، بین اکوتیپهای زیره مورد مطالعه تنوع ژنتیکی وجود دارد. از سوی دیگر بین تنوع ژنتیکی موجود در اکوتیپهای جمع آوری شده و موقعیت جغرافیایی، در بیشتر موارد ارتباط وجود داشت. | ||
کلیدواژهها | ||
بایپلات؛ تجزیه به مختصات اصلی؛ تجزیه خوشهای | ||
مراجع | ||
باقری عبدالرضا، محمودی علیاکبر (1381) زیره سبز، فناوری تولید و فرآوری. انتشارات دانشگاه فردوسی مشهد. بهادر یاسر ، محمدآبادی محمدرضا، خضری امین و همکاران (1395) مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های زنبور عسل استان کرمان با استفاده از نشانگرهای ISSR. 7(13)، 56-49. عسکری ناهید ، باقی زاده امین ، محمدآبادی محمدرضا (1389) بررسی تنوع ژنتیکی در چهار جمعیت بز کرکی رائینی با استفاده از لوکوس های بین ریزماهواره (ISSR). 5(2)، 56-49. فارسی محمد، باقری عبدالرضا (1388) اصول اصلاح نباتات. انتشارات جهاد دانشگاهی مشهد. نقوی محمدرضا، قره یاضی بهزاد، حسینی سالکده قاسم (1392) نشانگرهای مولکولی. موسسه انتشارات و چاپ دانشگاه تهران. تهران. References Anderson JA, Churchill GA, Sutrique JE et al. (1993) Optimizing parental selection for genetic linkage maps. Genome Biol 36, 181-186. Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010) Study of genetic diversity in four populations of Raeini cashmere goat using ISSR markers. Modern Genet J 5, 49-56 (In Persian). Askari N, Mohammadabadi MR, Baghizadeh A (2011) ISSR markers for assessing DNA polymorphism and genetic characterization of cattle, goat and sheep populations. Iran J Biotechnol 9, 222-229. Bagheri AA, Mahmoodi AA (2002) Cumin production and processing technology. Department of agronomy, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University Press 143-150 (In Persian). Baghizadeh A, Salar Karimi M, Pourseyedi SH (2013) Genetic diversity assessment of Iranian green cumin genotypes by RAPD molecular markers. Intl J Agron Plant Prod 4, 472-479. Bahador Y, Mohammadabadi MR, Khezri A et al. (2016) Study of Genetic Diversity in Honey Bee Populations in Kerman Province using ISSR Markers. Res Anim Prod 7, 186-192 (In Persian). Bahraminejad AR, Mohammadi-Nejad GH, Abdul Kadir M, Bin- Yusop MR (2012) Molecular diversity of Cumin (Cuminum cyminum L) using RAPD markers. Aust J Crop Sci 6, 194-199. Choudhary SH, Meena RS, Singh R, Panwar A (2015) Analysis of diversity among cumin (Cuminum cyminum) cultivars using RAPD markers. Indian J Agr Sci 85, 117-121. Farsi M, Bagheri AR (2009) Principles of Plant Breeding. Mashhad University Jihad Publications. 368 pp (In Persian). Ghasemi M, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010) Determination of genetic polymorphism in Kerman Holstein and Jersey cattle population using ISSR markers. Aust J Basic Appl Sci 4, 5758-5760. Giovannoni JJ, Wing RA, Ganal MW, Tanksley SD (1991) Isolation of molecular markers from specific chromosomal intervals using DNA pools from existing mapping populations. Nucleic Acids Res 19, 6553-6558. Hashemi H, Safarnejad A, Bagheri AR (2008) Study of genetic diversity of Bunium Persicum Boiss using RAPD markers. Iranian J Rangelands and Forest Plant Breed 16 (2): 246-238. Kafi M, Rashed-Mohassel MH, Koocheki A, Mollafilabi A (2002) Cumin Production Technology and Processing. Ferdowsi University Press, Mashhad, Iran. Kapital B, Feyissa T, Yohannes P, Said M (2015) Molecular diversity study of black cumin (Nigella sativa L) from Ethiopia as revealed by Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. Afr J Biotechnol 14, 1543-1551. Kimura M, Crow JF (1963) The measurement of effective population number. Evolution 17, 279-288. Koocheki AR, Nasiri-Mahallati M, Najafi F (2004) Biological diversity of medicinal and aromatic plants in Iranian ecosystems. Iran Agric Res 2, 208-215. Kumar P, Gupta VK, Misra AK et al. (2009) Potential of molecular markers in plant biotechnology. Plant Omics 2, 141-162. Lewontin RC (1972) The apportionment of human diversity. Evolution Biology 6: 381–398. Lynch M, Milligan B (1994) Analysis of population-genetic structure using RAPD markers. Mol Ecol 3, 91-99. Madhuri P (2012) Appraisal of Genetic Diversity in Cuminum cyminum L using Molecular Markers. Intl J of Life Sci 3, 143-156. Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (2017) Using Inter Simple Sequence Repeat Multi-Loci Markers for Studying Genetic Diversity in Kermani Sheep. J Res Dev 5, 154. Naghavi MR, Gharehyazi B, Hosseini-Salekdeh GH (2013) Molecular markers. University of Tehran Publications, Tehran. 340 pp (In Persian). Nei M (1987) Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University Press.512 pp. Nei M, Li WH (1979) Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases. Proceedings of the Natural Academy of Science of the USA 76, 5269-5273. Powell W, Morgante M, Andre C et al. (1996) The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Mol Breed 2, 225-238. Rostami-Ahmadvandi H, Cheghamirza K, Kahrizi D, Bahraminejad S (2013) Comparison of morpho-agronomic traits versus RAPD and ISSR markers in order to evaluate genetic diversity among Cuminum cyminum L accessions. Aust J Crop Sci 7, 367-361. Singh SK, Kakani RK, Meena RS et al. (2012) Genetic diversity among Indian varieties of foeniculum vulgare and Cuminum cyminum L based on nuclear ribosomal DNA and RAPD analyses. Intl J of Agri and Stat Sci 8(2)493-502. Sudupak MA, Akkoya MS, Kence A (2002) Analysis of relationships among perennial and annual cicer species growing in Turkey using RAPD markers. Theor Appl Genet 105, 1220-1228. Uzun A, Yesiloglu T (2012) Genetic diversity in citrus, genetic diversity in plants, Prof. Mahmut Caliskan (Ed.), ISBN: 978-953-51-0185-7, In Tech, Available from: http://www.intechopen.com/books/ genetic diversity- in-plants/genetic-diversity-in-citrus PP: 213-231. Wright S (1951) The genetical structure of populations. Ann of Eur Genet 15, 323-354. Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015) Associations of inter simple sequence repeat loci with predicted breeding values of body weight in Sheep. Small Rumint Res 132, 123-127. Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR et al. (2011) Genetic variation of Mehraban sheep using two inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Afr J Biotechnol 10, 1812-1817. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 726 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 542 |