
تعداد نشریات | 26 |
تعداد شمارهها | 447 |
تعداد مقالات | 4,557 |
تعداد مشاهده مقاله | 5,379,997 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 3,580,061 |
بررسی تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی اکوتیپهای زیره سبز کشتشده در مراتع مختلف استان یزد | ||
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی | ||
مقاله 4، دوره 11، شماره 4، اسفند 1398، صفحه 51-66 اصل مقاله (2.73 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22103/jab.2020.2523 | ||
نویسندگان | ||
سمیرا حسین جعفری1؛ امیر سعادت فر* 2؛ افسانه محکمی3؛ علی اکبر کریمیان4 | ||
1پژوهشگر پسادکتری، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد | ||
2استادیار، گروه گیاهان دارویی، پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، دانشگاه شهیدباهنر کرمان | ||
3کرمان -دانشگاه شهید باهنر- پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی | ||
4دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد | ||
چکیده | ||
هدف: با توجه به ارزش اقتصادی گیاه دارویی زیره سبز (Cuminum cyminum)، ارزیابی ژنتیکی و فیتوشیمیایی آن بمنظور نگهداری منابع ژنتیکی و دستیابی به عملکرد و کیفیت برتر اسانس، در برنامههای اصلاح نژاد امری حیاتی است. هدف از این پژوهش بررسی تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی اکوتیپهای مختلف زیره سبز در استان یزد میباشد. مواد و روشها: جهت بررسی تنوع ژنتیکی با 10 آغازگر ISSR، استخراج DNA از گیاهان زیره سبز چهار رویشگاه به روش CTAB انجام شد. کمیت و کیفیت DNA از روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز تعیین شد. باندهای واضح حاصل از الکتروفورز محصولات PCR بر روی ژل آگارز 5/1 درصد، امتیازدهی شدند. جهت بررسی تنوع فیتوشیمیایی با روش GC-MS، اسانسگیری به روش تقطیر با آب از زیره سبز انجام شد. نتایج: نتایج نشان داد که آغازگرهای ISSR-14 وISSR-13 بالاترین میزان PIC (39/0و 38/0)، MI (3/13 و 48/12) و تعداد باند (35 و 32) را دارا بودند. آنالیز خوشهای با ضریب تشابه جاکارد و الگوریتم UPGMA، چهار اکوتیپ را در هشت گروه طبقهبندی کرد. در آنالیز تجزیه به مختصات اصلی،17/57% از واریانس کل توسط سه مؤلفه بیان شد. نتایج این آنالیز با تجزیه خوشهای و با پراکندگی جغرافیایی نمونهها همخوانی داشت. آنالیز واریانس مولکولی تنوع درون و بین جمعیتی را به ترتیب 93 و 7 درصد از کل تنوع نشان داد. براساس نتایج GC-MS، ترکیبات Propanal، Benzenemethanol، 1-phenyl-1-butanol، γ-terpinene، β-Pinene و P-cymene به عنوان ترکیبات عمده اسانس شناسایی شدند. تجزیه خوشهای نمونهها براساس پارامترهای فیتوشیمیایی، رویشگاههای تفت، مهریز و اردکان را در یک گروه و رویشگاه بهاباد را در گروه دیگر قرار داد که با فاصله جغرافیایی مطابقت نداشت. نتیجهگیری: براساس یافتهها مشخص گردید که پتانسیل بالایی از تنوع در اکوتیپهای زیره سبز استان یزد وجود دارد. استفاده از نشانگر ISSR در ارزیابی تنوع ژنتیکی اکوتیپهای زیره موفقیتآمیز بود. نتایج آنالیز خوشهای براساس ترکیبات فیتوشیمیایی با خوشهبندی ژنتیکی همخوانی نداشت. | ||
کلیدواژهها | ||
تجزیه خوشهای؛ تنوع ژنتیکی؛ فیتوشیمی؛ گیاه دارویی؛ نشانگر ISSR | ||
مراجع | ||
ابراهیمیان مهسا، ابراهیمی محسن، مرتضویان سید محمد مهدی، رامشینی حسین (1396) بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی جمعیتهای ایرانی زیره سبز (Cuminum cyminum L.) با استفاده از نشانگر مولکولی SCoT. ژنتیک نوین 2 (12)، 292-285. باقی زاده امین، مشایخی زهرا، ابراهیمی محمدعلی (1397) بررسی تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی برخی از جمعیتهای پونهسا گربهای (Nepeta cataria L.) با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD و روش GC/MS. مجله تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران 5 (34)، 848-836. بهادر یاسر، محمدآبادی محمدرضا، خضری امین و همکاران (1395) مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های زنبور عسل استان کرمان با استفاده از نشانگرهای ISSR. فصلنامه پژوهش های تولیدات دامی 7 (13)، 49-56. جانی پور لیلا، فهمیده لیلا، فاضلی نسب بهمن (1397) ارزیابی ژنتیکی جمعیتهای مختلف زیره سبز با استفاده از نشانگرهای مولکولی DNA. مجله پژوهشهای سلولی و مولکولی (مجله زیست شناسی ایران) 1 (31)، 15-1. حقیرالسادات فاطمه، اژدری مریم، عروجعلیان فاطمه، امیدی میثم، عظیم زاده مصطفی (1393) بررسی ترکیبات شیمیایی اسانس بذر سه گیاه دارویی بومی استان یزد (زیره سیاه، زیره سبز و زنیان) و مقایسه قدرت آنتی اکسیدانی آنها. مجله علمی پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی یزد 6 (22)، 1603-1592. ضابط محمد، رحیمی آتنا، ایزانلو علی، علیزاده زهره (1398) بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپهای زیره سبز (Cuminum cyminum) خراسان با استفاده از نشانگرهای رپید و آی اس اس آر. مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 1 (11)، 98-75. عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (1389) برررسی تنوع ژنتیکی در چهار جمعیت بز کرکی رائینی با استفاده از لوکوس های بین ریزماهواره (ISSR). فصلنامه ژنتیک نوین 5 (2)، 56-49. محمودی رزاق، احسانی علی، زارع پیمان (1391) ویژگیهای ترکیبات شیمیایی، ضدباکتریایی و آنتیاکسیدانی اسانس زیره سبز. نشریه پژوهشهای صنایع غذایی 3 (22)، 321-311. References Adams RP (2007) Identification of essential oil components by gas chromatography/mass spectrometry. 4th edition, Allured Publishing Corporation, Carol Stream, USA. 804 p. Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010) Study of genetic diversity in four populations of Raeini cashmere goat using ISSR markers. Modern Genetics J 5 (2), 49-56 (In Persian). Askari N, Mohammad Abadi MR, Baghizadeh A (2011). ISSR markers for assessing DNA polymorphism and genetic characterization of cattle, goat and sheep populations. Iran J Biotech 9, 222–229 Baghizadeh A, Mashayekhi Z, Ebrahimi MA (2018) Investigation of genetic and phytochemical diversity of some catnip (Nepeta cataria L.) populations by RAPD molecular marker and GC/MS method. Iran. J Medic Aroma Plants 5 (34), 836-848. Bahador Y, Mohammadabadi MR, Khezri A et al. (2016) Study of Genetic Diversity in Honey Bee Populations in Kerman Province using ISSR Markers. Research on Animal Production 7 (13), 186-192 (In Persian). Bahraminejad A, Mohammadi-Nejad Gh, Abdul Kadir M, Bin Yusop MR (2012) Molecular diversity of Cumin (Cuminum cyminum L.) using RAPD markers. Aust J Crop Sci 6 (2), 194-199. Bahraminejad A, Mohammadi-Nejd Gh, Abdul Khadir M (2011) Genetic diversity evaluation of Cumin (Cuminum cyminum L.) based on phenotypic characteristics. Aust J Crop Sci 5 (3), 304-310. Baldemir A, Topcu H, Paksoy MY et al. (2017) First microsatellite markers for Scaligeria lazica Boiss. (Apiaceae) by next generation sequencing: population structure and genetic diversity analysis. Biotech Biotech Equip 1-10. Barrandeguy ME, Garcia MV (2014) Quantifying genetic diversity: the starting point for population genetic studies using molecular markers. J Genet 93 (2), 587-589. DK S, Tewari R, NK S, Singh Sh S (2016) Genetic Diversity Cucumber using Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). Transcriptomics 4 (1), 1-4. Ebrahimiyan M, Ebrahimi M, Mortazavian SMM, Ramshini H (2017) The structure and genetic diversity of Iranian cumin populations (Cuminum cyminum L.) using SCoT molecular markers. New Genet 2 (12), 285-292. Eskandari H, Kazemi K (2010) Response of different bread wheat (Triticum aestivum L.) genotypes to post-anthesis water deficit. Not Sci Biol 2, 49-52. Ghasemi M, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010). Determination ofgenetic polymorphism in Kerman Holstein and Jersey cattle population using ISSR markers. Austra J Basic Appl Sci 4, 5758–5760 Hadian J, Nejad Ebrahimi S, Mirjalili M et al. (2011) Chemical and genetic diversity of Zataria multiflora Boiss. Accessions growing wild in Iran. Chem Biodiv 8 (1), 176-188. Haghiroalsadat F, Azhdari M, Oroojalian F et al. (2015) The chemical assessment of seed essence of three native medicinal plants of Yazd province (Bunium premium, Cuminum cyminum, Trachyspermum copticum) and the comparison of their antioxidant properties. J Shahid Sadoughi Uni Medic Sci 6 (22), 1592-1603. Hossein Jafari S, Sepehry A, Soltanloo H, Karimian AA (2018) Genetic differentiation between bitter and sweet asafetida plants using ISSR markers. Mol Biol Rep 1-10. Janipour L, Fahmideh L, Fazeli Nasab B (2018) Genetic evaluation of different population of Cumin (Cuminum cyminum L.) using DNA molecular markers. J Cell Mol Res (Iran Biol) 1 (31), 1-15. Mahmoudi R, Ehsani A, Zare P (2012) Phytochemical, antibacterial and antioxidant properties of Cuminum cyminum L. essential oil. J Food Indus Res 3 (22), 311-321. Moghaddam M, Farhadi N (2015) Influence of environmental and geneic factors on resin yield, essential oil cotten and chemical composition of Ferula assa-foetida L. populations. J Appl Res Medic Aroma Plants 2 (2015), 69-76. Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (2017) Using Inter Simple Sequence Repeat Multi-Loci Markers for Studying Genetic Diversity in Kermani Sheep. J. Res Develop 5 (2),154 Mulpuri S, Muddanuru T, Francis G (2013) Start codon targeted (SCoT) polymorphism in toxic and non-taxic accessions of Jatropha curcas L. and development of a codominant SCAR marker. Plant Sci 207, 117-127. Nagy S, Poczai P, Cernak I et al. (2012) PICcalc: an online program to calculate polymorphic information content for molecular genetic studies. Biochem Genetics 50, 670-672. Parashar M, Malik C (2014) Appraisal of genetic diversity in Cuminum cyminum L. using molecular markers. Int J Life Sci 3, 143-156. Salami M, Rahimmalek M, Ehtemam MH (2017) Genetic Variability of Outcross and Selfed Fennel Based on Morphological and ISSR Markers. J Agri Sci Tech 19,157-172. Zabet M, Rahimi A, Izanlo A, Alizadeh Z (2019) Investigation of genetic variation in Cumin (Cuminum cyminum) ecotypes of Khorasan province using RAPD and ISSR markers. Agri Biotech J 1 (11), 75-98. Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015). Associations of Inter-Simple Sequence Repeat loci with predicted breeding values of body weight in Sheep. Small Ruminant Research 132, 123–127. Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR, Saki AA, Ershadi A, Banabazi MH, Abdolmohammadi AR (2011). Genetic variation of Mehraban sheepusing two inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Afric J Biotech 10, 1812–1817. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,631 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 464 |