
تعداد نشریات | 26 |
تعداد شمارهها | 447 |
تعداد مقالات | 4,557 |
تعداد مشاهده مقاله | 5,380,003 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 3,580,070 |
بررسی تنوعژنتیکی جمعیتهای بومی هندوانه ایران با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR | ||
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی | ||
دوره 16، شماره 1، فروردین 1403، صفحه 1-18 اصل مقاله (1.32 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22103/jab.2023.22199.1514 | ||
نویسندگان | ||
امین ارجمند1؛ محسن ابراهیمی* 2 | ||
1گروه آموزشی زراعت و اصلاحنباتات، دانشکدکان کشاورزی و منابع طبیعی ، دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
2گروه آموزشی علوم زراعی و اصلاح نباتات ، دانشکده فناوری کشاورزی ابوریحان، دانشگاه تهران ، تهران ، ایران | ||
چکیده | ||
هدف: هدف از انجام این تحقیق بررسی کارایی نشانگر مولکولی ISSR در تمایز جمعیتهای هندوانه مورد مطالعه ، تعیین میزان تشابه و فاصلهژنتیکی جمعیتها به منظور استفاده از پدیده هتروزیس و انتخاب والدین مناسب در برنامههای تولید بذر هیبرید هندوانه میباشد. مواد و روشها: در این تحقیق تنوعژنتیکی 24 جمعیت مختلف هندوانه از سراسر ایران با استفاده از 10 پرایمر ISSR مورد بررسی قرار گرفت. استخراج DNA با استفاده از روش CTAB انجام گرفت. پس از انجام PCR امتیاز دهی دادههای مولکولی به صورت صفر و یک داده شد. شاخصهای مرتبط با نشانگر شامل تعدادکلباندها، تعدادباندهایچندشکل، درصدچندشکلی، شاخصنشانگری ( MI ) ، شاخص قدرتتفکیک (RP) و محتوایاطلاعاتچندشکلی(PIC) اندازهگیری شد. به منظور انجام تجزیهخوشهای، از نرمافزار NTSYS و Excel و به منظور تجزیه واریانس مولکولی و تجزیه به مختصات اصلی نیز از نرمافزار GenALEx استفاده شد. نتایج: در این تحقیق در مجموع 202 باند تولید شد که از این تعداد 184 باند چندشکل بود. میانگین تعداد کل باند و باندهای چندشکل در این مطالعه به ترتیب 2/20 و 4/18 بهدست آمد. بیشترین درصد چندشکلی مربوط به آغازگر ISSR6 با 100 درصد و کمترین میزان چندشکلی مربوط به آغازگر ISSR5 با 80 درصد بود. میانگین درصد چندشکلی در این مطالعه نیز 90/0 بهدست آمد. مقدار شاخص PIC در این تحقیق بین 26/0 تا 44/0 متغییر و میانگین PIC نیز 35/0 بود. پس از انجام تجزیهخوشهای جمعیتهای مورد مطالعه در سطح تشابه 55 درصد در پنج گروه قرار گرفتند. نتایج حاصل از تجزیه واریانسمولکولی و تجزیه به مختصاتاصلی در جمعیتهای مورد مطالعه نتایج نشان داد 14 درصد از تنوع مربوط به بین جمعیتهای مورد مطالعه و 86 درصد از تنوع مربوط به درون جمعیتهای مورد مطالعه میباشد. نتایج تجزیه به مختصاتاصلی نیز نتایج حاصل از تجزیهخوشهای را تایید کرد . نتیجهگیری: با توجه به نتایج بهدست آمده نشانگر مولکولی ISSR کارایی لازم جهت تمایز جمعیتهای مورد مطالعه را دارد و از طرفی با توجه به تنوعژنتیکی قابل ملاحظه بین و درون جمعیتهای مورد مطالعه از ژنوتیپهای استفاده از شده در این تحقیق میتوان به عنوان جمعیت اولیه در برنامههای تولید بذر هیبرید هندوانه استفاده کرد و همچنین از جمعیتهای فاریاب و میناب با توجه به اینکه بیشترین فاصلهژنتیکی را داشتند به منظور استفاده از هتروزیس در پروژههای تولید بذر هیبرید هندوانه به عنوان والدین تلاقی میتوان استفاده کرد. | ||
کلیدواژهها | ||
تشابهژنتیکی؛ فاصلهژنتیکی؛ هتروزیس؛ هیبرید | ||
مراجع | ||
بهادر یاسر، محمدآبادی محمدرضا، خضری امین، و همکاران (1395) مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیتهای زنبور عسل استان کرمان با استفاده از نشانگرهای ISSR. پژوهشهای تولیدات دامی 13، 192-186.
عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (1389). مطالعه تنوع ژنتیکی در چهار جمعیت بز کرکی راینی با استفاده از نشانگرهای ISSR. مجله ژنتیک نوین 5، 56-49.
References
Amani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR, et al. (2011) Genetic variation of Mehraban sheepusing two inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Afr J Bio 10, 1812–1817.
Askari N, A Baghizadeh, MR Mohammadabadi (2010) Study of genetic diversity in four populations of Raeini cashmere goat using ISSR markers. Modern Genet J 5 (2), 49-56 (In Persian).
Askari N, MohammadAbadi MR, Baghizadeh A (2011) ISSR markers for assessing DNA polymorphism and genetic characterization of cattle, goat and sheep populations. Iran J Biotechnol 9, 222–229.
Bahador Y, MR Mohammadabadi, A Khezri, et al. (2016) Study of Genetic Diversity in Honey Bee Populations in Kerman Province using ISSR Markers. Res Anim Prod 7 (13), 186-192 (In Persian).
Bekheet SA, Taha HS, Hanafy MS, Solliman ME (2008) Morphogenesis of sexual embryos of date palm cultured in vitro and early identification of sex type. J Appl Sci Res 4, 345-352.
Che K, Liang C, Wang Y, et al. (2012) Genetic assessment of watermelon germplasm using the AFLP technique. Hort Sci 137, 311-315.
Dane F , Liu J (2007) Diversity and origin of cultivated and citron type watermelon (Citrullus lanatus). Genet Resour Crop Evol 54(6), 1255-1265.
FAO. 2021. FAOSTAT. Available http://faostat3.fao.org/download/Q/QC/E
Ghasemi M, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2010) Determination of genetic polymorphism in Kerman Holstein and Jersey cattle population using ISSR markers. Aus J Basic Appl Sci 4, 5758-5760.
Ipek Uluturk Z, Frary A, Doganlar S (2011) Determination of genetic diversity in watermelon (Citrullus lanatus). Jour Crop Sci 5, 1832-1836.
Laurentin H (2009) Data analysis for molecular characterization of plant genetic resources. Genet Resour Crop Evol 56(2), 277-292.
Levi A, Thomas CE, Newman M, et al. (2004) ISSR and AFLP markers differ among American watermelon cultiva rs with limited genetic diversity. J Am Soc Hortic Sci 129(4), 553-558.
Levi A, Wechter P, Davis A (2009) EST-PCR markers representing watermelon fruit genes are polymorphic among watermelon heirloom cultivars sharing a narrow genetic base. Plant Gen Res Char Utl 7(1), 16-32.
Maggs K, Christiansen JL (2003) Variability in namibian landraces of watermelon (Citrullus lanatus). Euphytica 132(3), 251-258.
Meimberg H, Abele T, Bräuchler C, et al. (2006) Molecular evidence for adaptive radiation of Micromeria Benth.(Lamiaceae) on the Canary Islands as inferred from chloroplast and nuclear DNA sequences and ISSR fingerprint data. Mol Phylogenet Evol 41, 566-578.
Mohammadabadi M, Askari N (2012) Characterization of Genetic structure using ISSR-PCR markers: cattle, goat and sheep populations. LAP LAMBERT Academic Publishing, Saarbrusken, Germany 120pp.
Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (2017) Using inter simple sequence repeat multi-loci markers for studying genetic diversity in Kermani sheep. J Res Dev 5, 154.
Mohammadabadi MR, Oleshko V, Oleshko O, et al. (2021) Using inter simple sequence repeat multi-loci markers for studying genetic diversity in Guppy fish. Turk J Fish Aquatic Sci 21, 603-613.
Mohammadi R, Panahi B, Amiri S (2020) ISSR based study of fine fescue (Festuca ovina L.) highlighted the genetic diversity of Iranian accessions. Cytol Genet 54, 257-263.
Moshrefi-Araghi A, Nemati H, Azizi M, et al. (2019) Assessment of phytochemical and agromorphological variability among different wild accessions of Mentha longifolia L. cultivated in field condition. Ind Crops Prod 140, 111698.
Mujaju C, Sehic J, Werlemark G, et al. (2010) Genetic diversity in watermelon (Citrullus lanatus) landraces from Zimbabwe revealed by RAPD and SSR markers. Hereditas 147(4), 142-153.
Nazem V, Sabzalian MR, Saeidi G, et al. (2019) Essential oil yield and composition and secondary metabolites in self-and open-pollinated populations of mint (Mentha spp.). Ind Crops Prod 130, 332-340.
Rodrigues L, van den Berg C, Póvoa O, et al. (2013) Low genetic diversity and significant structuring in the endangered Mentha cervina populations and its implications for conservation. Biochem Syst Ecol 50, 51-61.
Romão RL (2000) Northeast Brazil: A secondary center of diversity for watermelon (Citrullus lanatus). Genet Resour Crop Evol 47(2), 207-213.
Rostami-Ahmadvandi H, Cheghamirza K, Kahrizi D, et al. (2013) Comparison of morphoagronomic traits versus RAPD and ISSR markers in order to evaluate genetic diversity among (Cuminum cyminum L). accessions. Aust J Crop Sci 7, 361.
Selseleh M, Hadian J, Ebrahimi SN, et al. (2019) Metabolic diversity and genetic association between wild populations of Verbascum songaricum (Scrophulariaceae). Ind Crops Prod 137, 112-125.
Singh AK, Rana MK, Singh S, et al. (2014) CAAT box-derived polymorphism (CBDP): a novel promoter-targeted molecular marker for plants. J Plant Biochem Biot 23, 175–183.
Solmaz I, Sari N, Aka Y, Mendi N (2010) The genetic characterization of Turkish watermelon (Citrullus lanatus) accessions using RAPD markers. Genet Res Crop Evol 57(5), 763-771.
Song Z, Li X, Wang H, Wang J (2010) Genetic diversity and population structure of Salvia miltiorrhiza Bge in China revealed by ISSR and SRAP. Genet 18(4), 241–249.
Szamosi C, Solmaz I, Sari N, Barsony C (2009) Morphogical characterization of Hungarian and Turkish watermelon (Citrullus lanatus) Matsum. et Nakai) genetic resources. Genet Res Crop Evol 56, 1091-1105.
Wang Z, Liao L, Yuan X, et al. (2013) Genetic diversity analysis of Cynodon dactylon (bermudagrass) accessions and cultivars from different countries based on ISSR and SSR markers. Bioc syst ecol 46, 10 8115.
Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015) Associations of Inter-Simple Sequence Repeat loci with predicted breeding values of body weight in Sheep. Small Rumin Res 132, 123–127. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 320 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 305 |