
تعداد نشریات | 26 |
تعداد شمارهها | 447 |
تعداد مقالات | 4,557 |
تعداد مشاهده مقاله | 5,380,003 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 3,580,070 |
مطالعه مولکولی ژنهای Tsst، Eta و Etb در باکتری Staphylococcus aureus جدا شده از بیماران مبتلا به زردزخم در میان کودکان شهر دیوانیه عراق | ||
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی | ||
دوره 17، شماره 2، اردیبهشت 1404، صفحه 325-342 اصل مقاله (588.27 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22103/jab.2025.25015.1682 | ||
نویسندگان | ||
عمار الجبوری* 1؛ مجید الشیبلی2 | ||
1گروه تجزیه و تحلیل آسیبشناسی، دانشکده علوم، دانشگاه القادسیه، عراق | ||
2گروه زیستشناسی، دانشکده آموزش، دانشگاه القادسیه، عراق | ||
چکیده | ||
هدف: Staphylococcus aureus یک پاتوژن فرصتطلب و همهکاره است که مسئول طیف وسیعی از بیماریهای انسانی، از عفونتهای سطحی پوست گرفته تا شرایط سیستمیک تهدیدکننده حیات است. یکی از تظاهرات بالینی رایج آن زردزخم است. عفونتی مسری در پوست که عمدتاً کودکان را تحت تأثیر قرار میدهد و معمولاً با S. aureus بهعنوان عامل اصلی بیماری همراه است. شیوع این باکتری در عفونتهای پوستی و بافت نرم به یک نگرانی رو به رشد در حوزه سلامت عمومی، بهویژه در جمعیتهای کودکان و مناطقی با دسترسی محدود به خدمات درمانی پیشرفته تبدیل شده است. مطالعه حاضر با هدف بررسی حضور مولکولی ژنهای tsst، eta و etb در جدایههای S. aureus بهدستآمده از کودکان مبتلا به زردزخم در شهر دیوانیه عراق انجام شد. مواد و روشها: این مطالعه بر روی جدایههای بالینی بهدستآمده از کودکان مبتلا به زردزخم که به درمانگاههای پوست در شهر دیوانیه مراجعه کرده بودند انجام شد. در مجموع ۲۱ نمونه سواب از ضایعات پوستی آلوده با استفاده از سوابهای پنبهای استریل جمعآوری گردید. DNA ژنومی از جدایههای تأییدشده S. aureus استخراج شد. برای تأیید هویت جدایهها، PCR هدفمند بر روی ژن 16S rRNA انجام گرفت. حضور ژنهای tsst، eta و etb با استفاده از PCR معمولی و پرایمرهای اختصاصی بررسی شد. نتایج: تمام جدایههای S. aureus باند مشخصی به اندازه ۱۵۰۰ جفت باز در PCR مربوط به ژن 1616S rRNA نشان دادند که بیانگر موفقیتآمیز بودن تکثیر این ژن هدف بود. این نتیجه همچنین کیفیت بالای DNA باکتریایی استخراجشده و اختصاصی بودن پرایمرهای مورد استفاده را نشان داد. ماهیت حفاظتشده ژن 16S rRNA آن را به یک نشانگر مولکولی قابل اعتماد برای شناسایی باکتری تبدیل کرده است. علاوه بر این، حضور ژنهای tsst-1، eta و etb با استفاده از PCR بررسی شد و هر ژن الگوی تکثیر خاصی از خود نشان داد. از میان ۲۱ جدایه بالینی، ۱۱ مورد (۵۲.۴٪) برای ژن tsst-1 مثبت بودند. ژنهای eta و etb نیز شناسایی شدند، اما با فراوانیهای متفاوت، که نشاندهنده توزیع متفاوت این عوامل ویرولانس در بین جدایههاست. نتیجهگیری: این مطالعه حضور مولکولی ژنهای ویرولانس کلیدی tsst-1، eta و etb را در جدایههای S. aureus از موارد زردزخم در کودکان برجسته میکند. شناسایی این ژنهای سمی، بهویژه شیوع بالای tsst-1، پتانسیل بیماریزایی سویههای در گردش را برجسته کرده و اهمیت غربالگری مولکولی در تشخیصهای بالینی و راهبردهای کنترل عفونت را تقویت میکند. | ||
کلیدواژهها | ||
استافیلوکوکوس اورئوس؛ زردزخم؛ ژنهای ویرولانس؛ کودکان؛ PCR | ||
مراجع | ||
Ahmad-Mansour, N., Loubet, P., Pouget, C., Dunyach-Remy, C., Sotto, A., Lavigne, J. P., & Molle, V. (2021). Staphylococcus aureus toxins: an update on their pathogenic properties and potential treatments. Toxins, 13(10), 677. https://doi.org/10.3390/toxins13100677 Al-Bukhalifa, M. A., & Al-Tameemi, H. M. (2024). First whole genome sequencing of Staphylococcus aureus isolates from Iraq: Insights into zoonotic relations and biofilm-related genes. Open Veterinary Journal 14(12), 3269-3288. https://doi.org/10.5455/OVJ.2024.v14.i12.12. Alfeky, A. E., Tawfick, M. M., Ashour, M. S., & El-Moghazy, A. A. (2022). High prevalence of multi-drug resistant methicillin-resistant Staphylococcus aureus in tertiary Egyptian hospitals. Journal of Infection and Public Health, 16(5), 795-806. https://doi.org/10.3855/jidc.15833 Al-Kahfaji, M. H. A. M. (2022). Human skin infection: A review study. Biomedicine and Chemical Sciences, 1(4), 254-258. https://doi.org/10.48112/bcs.v1i4.259 AlMosawi, R., Jasim, H. A., & Haddad, A. (2024). Identification of S. aureus by specific 16S rRNA and detection of mecA gene from clinical samples in patients of Basrah governorate in Iraq. Access Microbiology, 000848-v1. https://doi.org/10.1099/acmi.0.000848.v1 Alsanie, W. F., Felemban, E. M., Farid, M. A., Hassan, M. M., Sabry, A., & Gaber, A. (2018). Molecular identification and phylogenetic analysis of multidrug-resistant bacteria applying 16S rDNA sequencing. Journal of Pure and Applied Microbiology, 12(2), 489–496. https://doi.org/10.22207/JPAM.12.2.07 Bazghandi, S. A., Arzanlou, M., Peeridogaheh, H., Vaez, H., Sahebkar, A., & Khademi, F. (2021). Prevalence of virulence genes and drug resistance profiles of Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical specimens. Jundishapur Journal of Microbiology, 14(8), e118452. https://doi.org/10.5812/jjm.118452 Becker, K., Roth, R., & Peters, G. (1998). Rapid and specific detection of toxigenic Staphylococcus aureus: Applying two multiplex PCR enzyme immunoassays for amplification and hybridization of staphylococcal enterotoxin genes, exfoliative toxin genes, and toxic shock syndrome toxin 1 gene. Journal of Clinical Microbiology, 36(9), 2548-2553. https://doi.org/10.1128/JCM.36.9.2548-2553.1998 Brazel, M., Desai, A., Are, A., & Motaparthi, K. (2021). Staphylococcal scalded skin syndrome and bullous impetigo. Medicina (Kaunas), 57(11), 1157. https://doi.org/10.3390/medicina57111157 Brosnahan, A. J., & Schlievert, P. M. (2011). Gram-positive bacterial superantigen outside-in signaling causes toxic shock syndrome. FEBS Journal, 278(23), 4649–4667. https://doi.org/10.1111/j.1742-4658.2011.08151.x Camaione, S. (2025). Biochemical characterization of a novel staphylococcal protein A (SpA) interaction with human fibronectin (Fn) and its role in Fn-dependent bacterial adhesion to host cells. IRIS Institutional Research Information System - AIR Institutional Research Archive. https://hdl.handle.net/11571/1518016 Chen, H., Zhang, J., He, Y., Lv, Z., Liang, Z., Chen, J., Li, P., Liu, J., Yang, H., Tao, A., & Liu, X. (2022). Exploring the role of Staphylococcus aureus in inflammatory diseases. Toxins (Basel), 14(7), 464. https://doi.org/10.3390/toxins14070464 Del Barrio-Tofiño, E., López-Causapé, C., & Oliver, A. (2020). Pseudomonas aeruginosa epidemic high-risk clones and their association with horizontally-acquired β-lactamases: 2020 update. International Journal of Antimicrobial Agents, 56(6), 106196. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.106196 Díaz-Formoso, L., Silva, V., Contente, D., Feito, J., Hernández, P. E., Borrero, J., Igrejas, G., Del Campo, R., Muñoz-Atienza, E., Poeta, P., & Cintas, L. M. (2023). Antibiotic resistance genes, virulence factors, and biofilm formation in coagulase-negative Staphylococcus spp. isolates from European hakes (Merluccius merluccius, L.) caught in the Northeast Atlantic Ocean. Pathogens, 12(12), 1447. https://doi.org/10.3390/pathogens12121447 Gumaa, M. A., Idris, A. B., Bilal, N. E., & Hassan, M. A. (2021). First insights into molecular basis identification of 16S ribosomal RNA gene of Staphylococcus aureus isolated from Sudan. BMC Research Notes, 14(1), 240. https://doi.org/10.1186/s13104-021-05569-w Hajalizadeh, Z., Dayani, O., Khezri, A., Tahmasbi, R., Mohammadabadi, M., Solodka, T., Kalashnyk, O., Afanasenko, V., & Babenko, O. (2021). Expression of calpastatin gene in Kermani sheep using real-time PCR. Journal of Livestock Science and Technologies, 9(2), 51-57. https://doi.org/10.22103/jlst.2021.18165.1381 Kadhum, H. H., & Abood, Z. H. (2022). Staphylococcus aureus incidence in some patients with atopic dermatitis in Baghdad City. Iraqi Journal of Biotechnology, 21(2), 13–20. https://jige.uobaghdad.edu.iq/index.php/IJB/article/view/472 Kot, B., Piechota, M., Jakubczak, A., Gryzińska, M., Witeska, M., Grużewska, A., Baran, K., & Denkiewicz, P. (2022). The prevalence of virulence determinants in methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from different infections in hospitalized patients in Poland. Scientific Reports, 12(1), 5477. https://doi.org/10.1038/s41598-022-09517-x Medugu, N., Imran, J., Musa-Booth, T. O., Makun, B., & Adegboro, B. (2023). A review of staphylococcal scalded skin syndrome. African Journal of Clinical and Experimental Microbiology, 24(3), 235–242. https://doi.org/10.4314/ajcem.v24i3.2 Mehrotra, M., Wang, G., & Johnson, W. M. (2000). Multiplex PCR for detection of genes for Staphylococcus aureus enterotoxins, exfoliative toxins, toxic shock syndrome toxin 1, and methicillin resistance. Journal of Clinical Microbiology, 38(3), 1032–1035. https://doi.org/10.1128/JCM.38.3.1032-1035.2000 Merriman, J. A., Mueller, E. A., Cahill, M. P., Beck, L. A., Paller, A. S., Hanifin, J. M., Ong, P. Y., Schneider, L., Babineau, D. C., David, G., Lockhart, A., Artis, K., Leung, D. Y., & Schlievert, P. M. (2016). Temporal and racial differences associated with atopic dermatitis Staphylococcus aureus and encoded virulence factors. mSphere, 1(6), e00295-16. https://doi.org/10.1128/mSphere.00295-16 Mohammadabadi, M. (2016). Inter-simple sequence repeat loci associations with predicted breeding values of body weight in kermani sheep. Genetics in the Third Millennium, 14(4), 4386-4393. https://sciexplore.ir/Documents/Details/472-591-539-924 Mohammadabadi, M., & Asadollahpour Nanaei, H. (2021). Leptin gene expression in Raini Cashmere goat using Real Time PCR. Agricultural Biotechnology Journal, 13(1), 197-214. https://doi.org/10.22103/jab.2021.17334.1305 Mohammadabadi, M., Akhtarpoor, A., Khezri, A., Babenko, O., Stavetska, R. V., Tytarenko, I., Ievstafiieva, Y., Buchkovska, V., Slynko, V., & Afanasenko, V. (2024a). The role and diverse applications of machine learning in genetics, breeding, and biotechnology of livestock and poultry. Agricultural Biotechnology Journal, 16(4), 413-442. https://doi.org/10.22103/jab.2025.24662.1644 Mohammadabadi, M., Babenko Ivanivna, O., Borshch, O., Kalashnyk, O., Ievstafiieva, Y., & Buchkovska, V. (2024c). Measuring the relative expression pattern of the UCP2 gene in different tissues of the Raini Cashmere goat. Agricultural Biotechnology Journal, 16(3), 317-332. https://doi.org/10.22103/jab.2024.24337.1627 Mohammadabadi, M., Kheyrodin, H., Afanasenko, V., Babenko Ivanivna, O., Klopenko, N., Kalashnyk, O., Ievstafiieva, Y., & Buchkovska, V. (2024b). The role of artificial intelligence in genomics. Agricultural Biotechnology Journal, 16(2), 195-279. https://doi.org/10.22103/jab.2024.23558.1575 Mohammadinejad, F., Mohammadabadi, M., Roudbari, Z., & Sadkowski, T. (2022). Identification of Key Genes and Biological Pathways Associated with Skeletal Muscle Maturation and Hypertrophy in Bos taurus, Ovis aries, and Sus scrofa. Animals, 12(24), 3471. https://doi.org/10.3390/ani12243471 Mohseni, M., Rafiei, F., & Ghaemi, E. A. (2018). High frequency of exfoliative toxin genes among Staphylococcus aureus isolated from clinical specimens in the north of Iran: Alarm for the health of individuals under risk. Iranian Journal of Microbiology, 10(3), 158–165. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30112153/ Mousavizadeh, A., Mohammad Abadi, M., Torabi, A., Nassiry, M. R., Ghiasi, H., & Esmailizadeh Koshkoieh, A. (2009). Genetic Polymorphism at the Growth Hormone Locus in Iranian Talli Goats by Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism (PCR-SSCP). Iranian Journal of Biotechnology, 7(1), 51-53. https://www.ijbiotech.com/article_7064.html Muhammad, J. A., Alzubaidi, A. F. A., Idris, K. A. H. M., & Kehail, M. A. (2024). S. aureus Colonization in Atopic Dermatitis Raises Global Concern. Academia Open, 9(2), 10-21070. https://doi.org/10.21070/acopen.9.2024.9150 Neamah, M. M. (2024). Prevalence of Exfoliative Toxin Genes (eta and etb) in Staphylococcus aureus Isolates from Tonsillitis, Wound, and Urinary Tract Infections in Iraq. Journal of Current Medical Research and Opinion, 7(11), 3724-3728. https://doi.org/10.52845/CMRO/2024/7-11-4 Omar, N. N., & Mohammed, R. K. (2021). A molecular study of toxic shock syndrome toxin gene (tsst-1) in β-lactam resistant Staphylococcus aureus clinical isolates. Iraqi Journal of Science, 62(3), 825–837. https://doi.org/10.24996/ijs.2021.62.3.13 Schmitt, T., Huber, J., Pircher, J., Schmidt, E., & Waschke, J. (2025). The impact of signaling pathways on the desmosome ultrastructure in pemphigus. Frontiers in Immunology, 15, 1497241. https://doi.org/10.3389/fimmu.2024.1497241 Shahsavari, M., Mohammadabadi, M., Khezri, A., Asadi Fozi, M., Babenko, O., Kalashnyk, O., Oleshko, V., & Tkachenko, S. (2023). Correlation between insulin-like growth factor 1 gene expression and fennel (Foeniculum vulgare) seed powder consumption in muscle of sheep. Animal Biotechnology, 34(4), 882–892. https://doi.org/10.1080/10495398.2021.2000997 Srivastava, S., Singh, V., Kumar, V., Verma, P. C., Srivastava, R., Basu, V., Gupta, V., & Rawat, A. K. (2008). Identification of regulatory elements in 16S rRNA gene of Acinetobacter species isolated from water sample. Bioinformation, 3(4), 173–176. https://doi.org/10.6026/97320630003173 Sulimova, G. E., Azari, M. A., Rostamzadeh, J., Mohammad Abadi M.R., & Lazebny O.E. (2007). κ-casein gene (CSN3) allelic polymorphism in Russian cattle breeds and its information value as a genetic marker. Russian Journal of Genetics 43, 73–79. https://doi.org/10.1134/S1022795407010115 Taher, F. S., & Othman, H. E. (2024). Molecular identification and genotyping of methicillin-resistant staphylococcus aureus (mrsa) in different clinical samples. Science Journal of University of Zakho, 12(2), 159-168. https://doi.org/10.25271/sjuoz.2024.12.2.1276 Tam, K., & Torres, V. J. (2019). Staphylococcus aureus secreted toxins and extracellular enzymes. Microbiology Spectrum, 7(2), eGPP3-0039-2018. https://doi.org/10.1128/microbiolspec.GPP3-0039-2018 Yassin, H. Y., Melconian, A. K., & Mahmood, S. S. (2022). Prevalence of exfoliative toxin genes among clinical isolates of Staphylococcus aureus in Iraq. Iraqi Journal of Agricultural Sciences, 53(2), 465–470. https://doi.org/10.36103/ijas.v53i2.1554 Zhao, H., Xu, S., Yang, H., He, C., Xu, X., Hu, F., Shu, W., Gong, F., Zhang, C., & Liu, Q. (2019). Molecular typing and variations in amount of tst gene expression of TSST-1-producing clinical Staphylococcus aureus isolates. Frontiers in Microbiology, 10, 1388. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.01388 | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 168 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 74 |